25 апреля Центризбирком России рассмотрел письмо Геннадия Зюганова, обжаловавшего нарушения на президентских выборах в 26 регионах России и на зарубежных избирательных участках в Латвии. По предложению Зюганова ЦИК выбрал для особой проверки три субъекта Федерации: Дагестан, Калининградскую и Саратовскую области. Основная масса претензий сводится к несоответствию цифр в копиях протоколов, выданных наблюдателям на участках, цифрам в самих официальных протоколах, переданных в вышестоящие комиссии. В Дагестане, Карачаево-Черкесии, Курской и Новосибирской областях по предложению КПРФ проведен повторный подсчет бюллетеней. Расхождений с официальными протоколами не выявлено, но остаются расхождения между протоколами и наблюдательскими копиями. В ряде таких случаев члены участковых и территориальных комиссий отрицают, что на наблюдательских копиях стоят их подписи, или же утверждают, что подписали копии, не обратив внимания на цифры. Центризбирком считает, что дальнейшее изучение вопроса, чьи цифры правильнее, входит в компетенцию прокуратуры. В Калининградской области, пересчитав бюллетени на 9 участках, получили не тот результат, что в протоколах. При пересчете Путин потерял 13 голосов, Жириновский - 4, Зюганов - 3, прибавилось 2 голоса за Подберезкина, 1 - за Памфилову и 14 недействительных бюллетеней. В сводную таблицу итогов выборов по стране придется вносить изменения.
Выступивший на заседании ЦИК председатель думской комиссии по избирательному законодательству коммунист Александр Салий привел другие факты нарушений, не упоминавшиеся в докладе Центризбиркома. В Дагестане 19 территориальных комиссий из 33-х отказались выдать наблюдателям копии протоколов, что может являться основанием для признания выборов на этих территориях недействительными. На некоторых участках наблюдатели обнаружили, что протоколы в стопке - двух разных цветов: белые и синеватые, хотя полиграфисты утверждают, что вся партия бюллетеней должна быть одного цвета. "Вы считали фантики, а не бюллетени", - сказал Салий членам Центризбиркома.
Председатель ЦИК Александр Вешняков посоветовал коммунистам в следующий раз предъявлять несовпадающие протоколы в ночь после голосования или на следующий день, чтобы бюллетени можно было пересчитать по горячим следам. Салий возразил, что расхождения в протоколах выявились только через неделю после голосования, когда вышестоящие комиссии огласили итоги подсчета.
В результате Центризбирком постановил подготовить промежуточный ответ Геннадию Зюганову, а данные по участкам, где обнаружились расхождения в протоколах и наблюдательских копиях, передать для дальнейшего изучения в прокуратуру.
Общаясь с журналистами, Александр Вешняков отметил, что вопрос о пересмотре итогов выборов в любом случае не стоит, так как количество участков, итоги выборов по которым были обжалованы, составляет всего 0,2% от общего числа участков в стране.