Первые три месяца существования Министерства оно возглавлялось исполняющим обязанности министра.
23 июля 1998 Министром был назначен член ЦК КПРФ Ю.Д.Маслюков, который вошел в Правительство вопреки рекомендации партии и в ответном письме товарищам сообщил, что согласился занять пост в обмен на 7 условий, в том числе передачу Минпромторгу промышленных функций Минэкономики, внешней торговли, в т.ч. военной, управления акциями6 формирования госзаказа, кураторство Минатома и РКА.
Министры:
и.о.ГАБУНИЯ Георгий Валерьевич. Назначен и.о. 8 мая 1998