Законом "О Конституционном Суде РСФСР" от 12 июля 1991 года было установлено, что судья КС получает жалованье, размер которого устанавливается Верховным Советом РСФСР и составляет не менее 10 минимальных зарплат. Кроме того, Верховный Совет может установить судьям КС надбавки за стаж работы в этой должности. Другие надбавки невозможны: судьи, имеющие одинаковый стаж в КС, получают одинаковое жалованье.
Вскоре после избрания состава КС, 14 ноября 1991 года Верховный Совет РСФСР принял Постановление "О должностном соответствии в оплате труда в структурах высших органов законодательной, исполнительной и судебной власти РСФСР". Предельный уровень зарплаты Председателя КС установлен на том же уровне, что и для Президента и Председателя Верховного Совета - в размере 21 минимальной зарплаты (на тот момент - 3780 руб.), каковой уровень соответствует максимальной, с учетом всех видов доплат, зарплате государственного служащего в РСФСР.
Через 4 дня Президиум ВС принял неопубликованное постановление об оплате труда работников правоохранительных органов (включая судей). Оклад заместителя председателя КС установлен в размере 19, судьи-секретаря - 17, члена КС - 15 минимальных зарплат. Тем же постановлением утверждены размеры надбавок, которые в то время еще не распространялись на судей КС. Установлены ежегодные доплаты за выслугу лет - от 1 оклада (при 2-летнем стаже) до 4 окладов (при 20-летнем стаже); ежемесячные надбавки за квалификационные классы - от 50 руб/мес (для судей 5-го класса) до 180 руб. (для судей высшего класса) на период до 1 января 1992 и от 100 до 300 руб с 1 января 1992.
2 декабря 1991 года принято Постановление Президиума Верховного Совета РСФСР "Об обеспечении деятельности судей Конституционного Суда РСФСР". Конституционному Суду выделено помещение в Доме Советов и 15 автомобилей ГАЗ-3102. Судьям КС предоставляется ежегодный отпуск - 48 календарных дней. Установлен порядок осуществления судьями права бесплатного проезда, оплаты командировочных и представительских расходов, расходов на телефонные переговоры. По вопросам охраны трудовых прав, другим условиям обеспечения деятельности, не урегулированным Законом о КС судьи приравнены к народным депутатам РСФСР.
С 1 января 1992 минимальная зарплата была повышена до 342 руб. и оклад Председателя КС стал составлять 7182 руб.
25 мая 1992, незадолго до индексации минимальной зарплаты в 2,63 раза, Президиум ВС РФ приостановил действие своего постановления о судьях от 18 февраля в части установления постоянной привязки окладов к минимальной зарплате и постановил пересчитать их на абсолютные величины исходя из уровня минимальной зарплаты, установленного законом от 6 декабря 1991 (342 рубля), а с 1 июня 1992 увеличить их в 1,8 раза. Оклад Председателя составил 12927 руб 60 коп или 14,4 минимальных зарплат.
2 июля 1992 года Верховный Совет назначил высшим руководителям государства, включая председателя КС, оклады в размере 21 минимальной зарплаты (на тот момент - 18900 руб.) и отменил свое прежнее решение о том, что оклад со всеми надбавками не может превышать этого уровня.
Постановлением Президиума ВС РФ от 21 сентября 1992 года "Об оплате труда работников судов в Российской Федерации" были установлены должностные оклады для заместителя Председателя КС - 95% от должностного оклада Председателя, для секретаря КС - 90%, для судей КС - 85%. Этим же постановлением утверждены размеры ежемесячной доплаты судьям и работникам аппаратов судов за квалификационные классы (для судей - от 15 до 30% оклада) и ежегодной доплаты за выслугу лет (от 2-кратного, за двухлетний стаж, до 6-кратного, за 20-летний стаж, оклада, исчисляемого с учетом надбавки за класс). Применительно к КС установлено, что стаж, дающий право на надбавку, исчисляется не со дня избрания в КС, как это предусмотрено законом, а включает время предшествующей работы по юридической специальности. Постановление введено в действие 1 августа 1992 года, но одновременно было установлено, что с этой же даты оклад председателя КС, от которого отсчитываются все остальные величины, "исчисляется в твердой сумме".
28 января 1993 года постановлением ВС оклад Председателя КС установлен с 1 декабря 1992 в размере 72 тыс. руб. в месяц, а постановление от 2 июля об увязке оклада с минимальной зарплатой отменено. Фактически на тот момент новый оклад председателя КС (равно как и Президента) составлял 32 минимальных зарплаты.
14 апреля 1993 года Верховный Совет повысил оклады руководителей ветвей власти, включая председателя КС, в 1,9 раза, что составило 136.800 руб.
Указом от 7 октября 1993 года, которым Б.Н.Ельцин предписал Конституционному Суду не созывать заседаний до принятия новой Конституции, за судьями КС были сохранены права и гарантии, предоставленные им законом о КС и действующими правовыми актами.
В последующие 2 года Президент четырежды повышал должностные оклады работников органов государственной власти: с января 1994 - в 1,9 раза; с июля 1994 - в 1,4; с апреля 1995 - в 1,3; с сентября 1995 - в 1,54 раза. Таким образом, с 1 сентября 1995 оклад Председателя КС, без учета надбавки, составлял 728.503 руб. 77 коп.
В федеральном конституционном законе о КС от 21 июля 1994 года материальные гарантии для судей КС устанавливались в виде отсылки к законодательству и иным правовым актам. В законе уже не содержалось ограничений на надбавки за выслугу лет, за ученую степень и классный чин. С учетом надбавок зарплата нового Председателя КС превысила зарплату Президента РФ. В абсолютных цифрах заработная плата судей КС (без вычета налогов) летом 1995 года варьировалась от 1.700.000 рублей у рядового судьи без ученой степени до 2.200.000 у Председателя КС, имеющего ученую степень доктора юридических наук.
14 и 15 сентября 1995 года Президент Ельцин издал указы "О мерах по обеспечению материальных гарантий независимости судей Конституционного Суда РФ" (N941) и "Об обеспечении деятельности Конституционного Суда РФ" (N947).
Указом 941 установлено, что денежное вознаграждение судьи КС состоит из должностного оклада; доплат за квалификационный класс, выслугу лет; надбавок за сложность, напряженность и специальный режим работы, денежных премий и других видов выплат, предусмотренных федеральными законами и иными нормативными правовыми актами (в том числе доплаты за ученую степень и за звание "заслуженный юрист Российской Федерации"); установлена также 20-процентная надбавка за знание и использование в работе иностранного языка. Оклад заместителя Председателя КС повышен до 98%, судьи-секретаря - до 95%, судьи - до 90% от председательского оклада, который остался равным окладу Президента. Кроме того для судей КС введены ежегодная материальная помощь при предоставлении отпуска, льготы при получении жилых помещений и оплате жилплощади, право бесплатного проезда и т.п.
Указом 947 установлен порядок бюджетного финансирования КС и ежегодного повышения его материально-технической оснащенности. Управлению делами Президента РФ поручено осуществлять медицинское, санитарно-курортное и социально-бытовое обслуживание судей и сотрудников аппарата КС, а также членов их семей в том же порядке, который установлен для сотрудников Правительства, а также прикрепить комбинат питания КС РФ к подсобным хозяйствам Управления делами Президента.
25 января 1997 указом N45 Президент повысил оклады судей КС и других судей в РФ с 1 февраля 1997 в 1,65 раза. Председательский оклад без надбавок составил, таким образом, 1.202.031 руб. 22 коп. Это составляет 14,4 минимальных зарплат, установленных законом с 1 января 1997, или около 215 долларов.
Указом N1929 от 24 ноября 2000 Президент поднял оклады судей и прокуроров в 1,2 раза с 1 декабря 2000.