На первом заседании 16 января 1996 комиссия избрала председателем И.Братищева (КПРФ), секретарем - Н.Зацепину (Народовластие). Комиссия провела три тура выборов Председателя Думы. При выборах заместителей Председателя Думы 18 января 1996 комиссия не понадобилась, т.к. голосование по пакету должностей проводилось без бюллетеней, через электронную систему.
Комиссия работала в комнате 4-20 нового здания.
Регламент не предусматривает существования Счетной комиссии в качестве постоянно действующего органа и предусматривает ее создание для проведения тайных голосований.
4 апреля 1997 при голосовании по кандидатурам на пост Уполномоченного по правам человека Дума решила поручить подсчет результатов составу Счетной комиссии, избранному 16 января 1996 с заменой двух депутатов. К этому времени сложили депутатские полномочия Б.Б.Жамсуев (РР, 5 марта 1997) и В.Н.Сергеенков (Нар., 13 ноября 1996). По предложению И.М.Братищева Дума приняла постановление о замене двух членов Комиссии - отсутствовавшей И.М.Хакамады (РР) и вице-спикера М.С.Гуцериева (ЛДПР) депутатами, которых предложили те же фракции: С.С.Семеновым (ЛДПР) и В.А.Шестаковым (РР). Постановление содержало не полный список Комиссии, а список замен. Таким образом можно считать, что 4 апреля 1997 Комиссия признана если не постоянно действующей, то постоянно существующей.
10 апреля 1998 постановлением Думы из Комиссии формально выведены сложившие полномочия Б.Б.Жамсуев (РР) и В.Н.Сергеенков (Нар.), введены в Комиссию В.И.Горбачев (Нар.), О.А.Финько (ЛДПР), А.К.Хамаев (РР), А.Э.Янковский (Яблоко).
22 января 1999 сложил полномочия А.Л.Головков (НДР).
15 мая 1999 из состава Комиссии выведены сложивший полномочия А.Л.Головков и А.Э.Янковский, введены в Комиссию С.Н.Гвоздева (НДР) и В.А.Десятников (РР).
